micro ct不仅在活1体动物和离体组织的分析研究中具有重要的应用，也在植物方面有着特殊的应用价值。可广泛应用于植物种子三维结构研究，无损探索种子腔体、胚和胚乳的变化；分析原位研究土壤中根系的三维形态结构；研究果实内部结构变化；以及植物茎流和植物水分等。通过micro ct对果实的无损扫描，也---察到果实的内部结构，小动物ct 成像，在营养学研究与蛀虫病检测方面有---的帮助。研究者将高原鼠兔作为研究对象。高原鼠兔为生活于海拔3200~5200米土坡上的啮齿动物，体态---，是青藏高原的特有物种。利用super nova ? pet/ct系统，小动物ct本地，观察高原鼠兔在低温环境下，其体内的肩胛骨处棕色脂肪状态。曾有研究表明，高海拔地区的鼠兔较低海拔鼠兔皮下脂肪会表现出脂肪代谢能力的适应性改变：棕色脂肪的含量增加，以及棕色脂肪的产热能力的增加。
---上因手术或外伤导致的颅骨损伤及其修复一直是骨1科研究的一个重要课题。---前用于颅骨损伤模型研究的实验动物有小鼠、大鼠、兔等。由于实验动物体型小，骨质部分（如板障）的微结构尺度更为细微，小动物ct，因此，利用micro ct对小动物颅骨损伤的修复过程进行研究，小动物ct重建，是颅骨修复研究中的重要手段。 micro ct研究了一例因胶原---性---而导致的大鼠---模型，---察到大鼠脚踝关节处发生了---病变，骨密度、骨小梁数量也因病变而发生改变。
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