植物根系的分枝结构是植物生命力的决定因素，根系的生长形态与植物的土壤环境和植物的基因型息息相关，因此根系的3d形态学分析是评估不同植物竞争优势的重要工具。由于植物的根生长在各种不透明的媒介中，这成为---观察植物根系在土壤中的生长情况的主要因素，是获得原位的根系生长情况的一个---挑战和障碍。传统的洗根扫描法能够清晰地展现根系，但却破坏了其原有的状态；微根窗法能够解决原位测量的问题，但却无法展示探索土壤内部的根系分布。
micro-ct 用于检测肺部微环境
肺是乳1腺癌细胞常见的转移器1官之一。但由于治1疗方法有限，据估计，60-70% 的乳1腺癌---死于肺转移。通常来讲，骨缺损uct，在乳1腺癌细胞到来之前，肺的微环境已经发生了变化。因此，通过监测肺部微环境进行早期诊断和治1疗---是非常---的。
实验发现，随着原发肿1瘤的生长，ct 图像中有细微的、均匀的弥漫性混浊，而肺组织的 h&e 染色显示炎性细胞浸润增加。在第 21 天和第 28 天，ct 图像和 h&e 染色显示所有荷瘤小鼠都有明显的炎1症细胞浸润。结果表明，micro-ct 可以用来观察肺内微环境的变化和转移情况。此外，与仅提供转移过程快照的组织病理学分析不同，micro-ct 还可以捕1捉到来自动物的纵向信息。
1. 空间分辨率(spatial resolution)在高对比度情况下，能区分相临小的物体的能力，所以也称高对比度分辨率，受系统几何参数的影响，决定了影像的清晰度。空间分辨率 = 高对比度分辨率
显微ct系统能够达到的空间分辨率，常常被引述为小的像素尺寸（也命名为“标称分辨率”）。但是，真实的空间分辨率不仅取决于图像中的像素大小，还受到x射线源焦点尺寸、平板探测器像素大小、系统结构设计、系统机械精度和重建校正算法处理等因素的影响。
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