除了结构性影像，其他的影像学都可以被称为功能影像学。脑功能成像是一种基于血氧浓度依赖性（ss）的脑功能成像技术，其基本原理是通过脑内血氧饱和度的改变来反映脑功能状态。按其实施方式可分为两类：静息态（resting-state fmri，rs-fmri）和任务态（task fmri，tfmri）。
因为动物难以完成某些具体的工作，所以在小动物中，常用的方法就是静息态的研究。所谓的静息态，就是在没有任何介入的情况下，将动物放入核磁1共振仪中，对其进行扫描。目前，已有的研究主要集中在静息态，即低频段（alff）和局部一致性（reho）等。另外，基于动物静息态数据我们还可以通过计算不同脑区ss信号的相关系数研究大脑功能连接（functional connection，fc)，更深层的基于功能连接的网络图还可进行图论相关指标的分析，如小“（small world）属性、“富人俱乐部”（rich club）等。目前，在阿尔兹1海默症和帕金1森病等与学习记忆和认知功能障碍有关的动物模型中，应用多的小动物功能影像学。
脑部炎1症检测
模型：成年雄性balb/c小鼠，缺血1h后再灌。
显像方式：尾静脉注射（3.7 mbq）18f-dpa714 一小时后，9.4t mri，静态扫描15分钟。
意义：18f-dpa-714为监测脑卒中后缺血区的炎1症反应提供了有效帮助，这将便于检测后续的抗1炎治1疗。
新生血管检测
模型：68岁老年男子，脑卒中2周后影像扫描。
显像方式：68ga-nodaga-rgd。
意义：68ga-nodaga-rgd可用于脑卒中后新生血管的pet显像。
小动物核磁的应用：
目前，1.5t或3t cmr对小鼠---模型的研究也逐渐开展起来。利用1.5t mri对小鼠缺血/再灌注模型的研究，对小鼠的心肌1梗死面积可以进行有效地评估，与高场强相 比，表现出---的可行性与实用性。对于非灌注损伤心肌1梗死的小 鼠模型，带小动物线圈和梯度回波序列的---3t cmr生成的图像有好的snr，并且能准确、迅速地评价心梗后长期的左心室---，包 括对射血分数、舒张末期容积、收缩末期容积、左室重量等等相关数据进行测定。利用---3t cmr扫描仪对小鼠进行对比增肌灌注成像，为今后小鼠---模型能够系统地研究各种心1血管---提供了新的理念和方法。
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