种子内部的形态学信息参数，以及胚芽和胚乳区域的瑕疵率等，是评估种子的出芽率和的关键信息。传统方法常采用内窥镜来分析种子内部的形态，然而这种方法只能获得有限的投影，受种子放置方位的影响，很多缺陷无法体现。
而micro ct通过投影重建、三维成像功能，可提供种子的不同角度的观察，对于种子内部结构展现全1面，例如裂隙、内部萌芽情况评估、病虫害情况等等。
hu hu（hounsfield units）是ct值的单位，以 ct 的发明人godfrey newss hounsfield 的名字命名。
mil 平均截距长度（mean intercept length，mil）是定量分析骨小梁的方法之一，该方法可以计算测试线在 roi 内部的截距长度.mil能够测定样品表面积与体积的比率(bs/bv），进而估计tb.n、tb.th和tb.sp。mil分布能够确定mil椭圆体的方向和各向---的程度（degree of anisotropy）。该方法的详细内容参见：distribution of membrane thickness determined by lineal ---ysis。 j microsc。 1978； 113：27-43。
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